在國務院督查組來臨之前，浙江已經掀起針對新開工項目的“清理風暴”，全省198個新開工項目因“存在問題”而被要求“暫停建設、限期整改”，沿海大通道“甬臺溫鐵路”赫然在列。浙江省要求各地發改、經貿、國土、環保、安監、銀監等部門，要根據各自職能，認真分析“問題項目”原因，提出整改措施。
浙江省發改委等六部門日前聯合發出的《關于對存在問題的新開工項目依法依規進行處理的通知》指出，經清理，上半年浙江省列入統計范圍的總投資1億元及以上的新開工項目(其中鋼鐵等重點行業投資3000萬元及以上)共869個，計劃總投資1716.3億元，已完成投資318.7億元。對照清理范圍，全省有109個項目因統計問題不應列入此次清理范圍；根據清理標準，全省有562個項目符合國家產業政策、項目審核程序、土地審批、環評審批、信貸政策執行規定以及安全生產等規定。但有198個項目存在一些問題，占列入統計范圍清理項目總數的22.8%。在存在問題的新開工項目中，有8個項目不符合項目審核程序規定，主要存在項目未經審核就開工建設問題；有157個項目不符合土地審批規定，其中未辦理農轉用手續但已辦理用地預審手續的項目有54個，未辦理任何用地手續的項目有103個；有48個項目不符合環評審批規定；有6個項目不符合貸款政策執行規定，主要存在項目未通過用地和環評審批等程序就發放貸款以及將流動資金貸款用于固定資產投資等問題。
據悉，在六部門審核發布的“存在問題的新開工項目”名單中發現，有“浙江沿海大通道”之稱的甬臺溫鐵路，體現在甬臺溫鐵路樂清段工程建設指揮部、臺州市黃巖區甬臺溫鐵路建設指揮部、甬臺溫鐵路三門段工程建設指揮部等，共涉及3個市近10個縣市區，存在的主要問題是各路段建設指揮部尚未為負責的路段辦理任何用地手續。有資料顯示，
